MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella putrefaciens 200 chromosome

Total Repeats: 71360

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017566	CAA	2	6	93	98	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386311793
2	NC_017566	GAC	2	6	106	111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311793
3	NC_017566	CAG	2	6	132	137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311793
4	NC_017566	ATGG	2	8	171	178	25 %	25 %	50 %	0 %	386311793
5	NC_017566	T	6	6	258	263	0 %	100 %	0 %	0 %	386311793
6	NC_017566	GTC	2	6	313	318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311793
7	NC_017566	GCCC	2	8	338	345	0 %	0 %	25 %	75 %	386311793
8	NC_017566	TGCTAA	2	12	425	436	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386311793
9	NC_017566	TCG	2	6	478	483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311793
10	NC_017566	TGG	2	6	539	544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386311793
11	NC_017566	ATT	2	6	557	562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386311793
12	NC_017566	TGG	2	6	569	574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386311793
13	NC_017566	TTG	2	6	597	602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386311793
14	NC_017566	ATC	2	6	621	626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311793
15	NC_017566	AAT	2	6	630	635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386311793
16	NC_017566	AAT	2	6	702	707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386311793
17	NC_017566	GAA	2	6	714	719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386311793
18	NC_017566	TAC	2	6	729	734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311793
19	NC_017566	AAG	2	6	796	801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386311793
20	NC_017566	TTC	2	6	804	809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386311793
21	NC_017566	CTTG	2	8	824	831	0 %	50 %	25 %	25 %	386311793
22	NC_017566	ACC	2	6	838	843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386311793
23	NC_017566	ATT	2	6	846	851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386311793
24	NC_017566	TTGG	2	8	913	920	0 %	50 %	50 %	0 %	386311793
25	NC_017566	AG	3	6	989	994	50 %	0 %	50 %	0 %	386311793
26	NC_017566	CTT	2	6	1022	1027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386311793
27	NC_017566	CGTG	2	8	1052	1059	0 %	25 %	50 %	25 %	386311793
28	NC_017566	TAC	2	6	1212	1217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311793
29	NC_017566	TGT	2	6	1237	1242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386311793
30	NC_017566	CG	3	6	1265	1270	0 %	0 %	50 %	50 %	386311793
31	NC_017566	TAAC	2	8	1306	1313	50 %	25 %	0 %	25 %	386311793
32	NC_017566	TGG	2	6	1343	1348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386311793
33	NC_017566	CAC	2	6	1358	1363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386311793
34	NC_017566	AG	3	6	1403	1408	50 %	0 %	50 %	0 %	386311793
35	NC_017566	AGA	2	6	1421	1426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386311793
36	NC_017566	TCT	2	6	1452	1457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386311793
37	NC_017566	CT	3	6	1600	1605	0 %	50 %	0 %	50 %	386311794
38	NC_017566	TTG	2	6	1638	1643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386311794
39	NC_017566	GAA	2	6	1670	1675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386311794
40	NC_017566	ACA	2	6	1682	1687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386311794
41	NC_017566	AAG	2	6	1697	1702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386311794
42	NC_017566	AGC	2	6	1752	1757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311794
43	NC_017566	GCT	2	6	1771	1776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311794
44	NC_017566	AGA	2	6	1819	1824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386311794
45	NC_017566	TTA	2	6	1936	1941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386311794
46	NC_017566	GC	3	6	1981	1986	0 %	0 %	50 %	50 %	386311794
47	NC_017566	GTG	2	6	2316	2321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386311794
48	NC_017566	GAA	2	6	2378	2383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386311794
49	NC_017566	ATC	2	6	2393	2398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311794
50	NC_017566	CAAT	2	8	2413	2420	50 %	25 %	0 %	25 %	386311794
51	NC_017566	GAT	2	6	2480	2485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311794
52	NC_017566	TGAT	2	8	2499	2506	25 %	50 %	25 %	0 %	386311794
53	NC_017566	GAA	2	6	2540	2545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386311794
54	NC_017566	ATGT	2	8	2552	2559	25 %	50 %	25 %	0 %	386311794
55	NC_017566	ATTT	2	8	2904	2911	25 %	75 %	0 %	0 %	386311795
56	NC_017566	CGTT	2	8	2925	2932	0 %	50 %	25 %	25 %	386311795
57	NC_017566	TAA	2	6	2960	2965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386311795
58	NC_017566	GC	3	6	3006	3011	0 %	0 %	50 %	50 %	386311795
59	NC_017566	TCG	2	6	3239	3244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311795
60	NC_017566	ACT	2	6	3473	3478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311795
61	NC_017566	ATT	2	6	3602	3607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386311795
62	NC_017566	ACA	2	6	3647	3652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386311795
63	NC_017566	GAT	2	6	3681	3686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311795
64	NC_017566	CTG	2	6	3778	3783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311795
65	NC_017566	AC	3	6	3800	3805	50 %	0 %	0 %	50 %	386311795
66	NC_017566	ATA	2	6	3872	3877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386311796
67	NC_017566	TTC	2	6	3897	3902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386311796
68	NC_017566	CGA	2	6	3969	3974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311796
69	NC_017566	CAT	2	6	3988	3993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311796
70	NC_017566	AGT	2	6	4005	4010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311796
71	NC_017566	TTCTGT	2	12	4080	4091	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386311796
72	NC_017566	GAT	2	6	4096	4101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311796
73	NC_017566	GAA	2	6	4132	4137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386311796
74	NC_017566	GCA	2	6	4147	4152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311796
75	NC_017566	TTA	2	6	4157	4162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386311796
76	NC_017566	CGG	2	6	4179	4184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386311796
77	NC_017566	GAT	2	6	4192	4197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311796
78	NC_017566	TGG	2	6	4215	4220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386311796
79	NC_017566	TCG	2	6	4281	4286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311796
80	NC_017566	TGAT	2	8	4490	4497	25 %	50 %	25 %	0 %	386311796
81	NC_017566	TCG	2	6	4550	4555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311796
82	NC_017566	ATT	2	6	4556	4561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386311796
83	NC_017566	TAA	2	6	4569	4574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386311796
84	NC_017566	GAC	2	6	4618	4623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311796
85	NC_017566	CAA	2	6	4689	4694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386311796
86	NC_017566	TGG	2	6	4710	4715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386311796
87	NC_017566	CAA	2	6	4758	4763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386311796
88	NC_017566	GAT	2	6	4816	4821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311796
89	NC_017566	AGTGA	2	10	4906	4915	40 %	20 %	40 %	0 %	386311796
90	NC_017566	CTG	2	6	4960	4965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311796
91	NC_017566	TCG	2	6	4991	4996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311796
92	NC_017566	GCCCGT	2	12	5014	5025	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386311796
93	NC_017566	GCG	2	6	5029	5034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386311796
94	NC_017566	CGT	2	6	5056	5061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311796
95	NC_017566	GGT	2	6	5080	5085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386311796
96	NC_017566	CTG	2	6	5159	5164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311796
97	NC_017566	GC	3	6	5245	5250	0 %	0 %	50 %	50 %	386311796
98	NC_017566	TGT	2	6	5261	5266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386311796
99	NC_017566	AAG	2	6	5273	5278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386311796
100	NC_017566	CAT	4	12	5355	5366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311796
101	NC_017566	CTT	3	9	5415	5423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386311796
102	NC_017566	ATTG	2	8	5439	5446	25 %	50 %	25 %	0 %	386311796
103	NC_017566	GCC	2	6	5472	5477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386311796
104	NC_017566	TTG	2	6	5657	5662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386311796
105	NC_017566	AGC	2	6	5672	5677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311796
106	NC_017566	TGA	2	6	5742	5747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311796
107	NC_017566	TGG	2	6	5789	5794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386311796
108	NC_017566	GTATT	2	10	5812	5821	20 %	60 %	20 %	0 %	386311796
109	NC_017566	ACTA	2	8	5896	5903	50 %	25 %	0 %	25 %	386311796
110	NC_017566	TTC	2	6	5920	5925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386311796
111	NC_017566	GCG	2	6	5962	5967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386311796
112	NC_017566	GAA	2	6	5983	5988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386311796
113	NC_017566	GGC	2	6	5989	5994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386311796
114	NC_017566	GTG	2	6	6005	6010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386311796
115	NC_017566	AAG	2	6	6020	6025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386311796
116	NC_017566	TGA	2	6	6180	6185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311796
117	NC_017566	GTT	2	6	6204	6209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386311796
118	NC_017566	TAA	2	6	6523	6528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386311797
119	NC_017566	ATT	2	6	6529	6534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386311797
120	NC_017566	A	6	6	6616	6621	100 %	0 %	0 %	0 %	386311797
121	NC_017566	CAG	2	6	6629	6634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311797
122	NC_017566	CTG	2	6	6645	6650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311797
123	NC_017566	GTT	2	6	6653	6658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386311797
124	NC_017566	T	6	6	6678	6683	0 %	100 %	0 %	0 %	386311797
125	NC_017566	ATG	2	6	6711	6716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311797
126	NC_017566	CAA	2	6	6730	6735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386311797
127	NC_017566	GCTG	2	8	6844	6851	0 %	25 %	50 %	25 %	386311797
128	NC_017566	ACA	2	6	6976	6981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386311797
129	NC_017566	CAC	2	6	7024	7029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386311797
130	NC_017566	ATTT	2	8	7064	7071	25 %	75 %	0 %	0 %	386311797
131	NC_017566	CGT	2	6	7073	7078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311797
132	NC_017566	T	6	6	7159	7164	0 %	100 %	0 %	0 %	386311797
133	NC_017566	CTC	2	6	7211	7216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386311797
134	NC_017566	TGA	2	6	7275	7280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311797
135	NC_017566	CGA	2	6	7281	7286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311797
136	NC_017566	TTGC	2	8	7307	7314	0 %	50 %	25 %	25 %	386311797
137	NC_017566	TGC	2	6	7396	7401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311797
138	NC_017566	GGCG	2	8	7410	7417	0 %	0 %	75 %	25 %	386311797
139	NC_017566	TGC	2	6	7440	7445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311797
140	NC_017566	GCA	2	6	7489	7494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311797
141	NC_017566	GCT	2	6	7537	7542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311797
142	NC_017566	ATT	2	6	7640	7645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386311798
143	NC_017566	ATT	2	6	7689	7694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386311798
144	NC_017566	CAA	2	6	7695	7700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386311798
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146	NC_017566	TTG	2	6	7803	7808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386311798
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148	NC_017566	TGCT	2	8	7872	7879	0 %	50 %	25 %	25 %	386311798
149	NC_017566	TAG	2	6	7910	7915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311798
150	NC_017566	GCT	2	6	7966	7971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311798
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152	NC_017566	TCG	2	6	8143	8148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311798
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154	NC_017566	GCA	2	6	8246	8251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311798
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156	NC_017566	CGCAAC	2	12	8424	8435	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386311798
157	NC_017566	GGCG	2	8	8456	8463	0 %	0 %	75 %	25 %	386311798
158	NC_017566	TCA	2	6	8516	8521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311798
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160	NC_017566	GCT	2	6	8639	8644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311798
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164	NC_017566	CGG	2	6	8987	8992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386311798
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166	NC_017566	GCG	2	6	9007	9012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386311798
167	NC_017566	TCAA	2	8	9190	9197	50 %	25 %	0 %	25 %	386311798
168	NC_017566	TAT	2	6	9251	9256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386311798
169	NC_017566	AGC	2	6	9312	9317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311798
170	NC_017566	TTTCG	2	10	9327	9336	0 %	60 %	20 %	20 %	386311798
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174	NC_017566	TTC	2	6	9609	9614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386311798
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248	NC_017566	CAC	2	6	14307	14312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386311801
249	NC_017566	ATC	2	6	14920	14925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311802
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252	NC_017566	AGT	2	6	15043	15048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311802
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257	NC_017566	CAG	2	6	15312	15317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311802
258	NC_017566	T	6	6	15380	15385	0 %	100 %	0 %	0 %	386311803
259	NC_017566	GTT	2	6	15471	15476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386311803
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261	NC_017566	ATG	2	6	15492	15497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311803
262	NC_017566	CAG	2	6	15511	15516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311803
263	NC_017566	CAT	2	6	15542	15547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311803
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265	NC_017566	GAT	2	6	15842	15847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311804
266	NC_017566	CGT	2	6	15946	15951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311804
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301	NC_017566	TTGA	2	8	17883	17890	25 %	50 %	25 %	0 %	386311805
302	NC_017566	TCAC	2	8	17925	17932	25 %	25 %	0 %	50 %	386311805
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